檢測認證中心掌理全國環境檢驗測定機構及機動車輛測定機構之許可與管理，執行檢測機構能力及品質系統監管，制定環境檢測相關法規，確保檢測數據公信力，推動環境檢驗測定品保品管制度，輔導各縣市政府環保機關環境檢驗室能力試驗，藉由參加實驗室認證及辦理國際比測，使品質系統管理及檢測技術能力與國際接軌，並配合政策辦理環境檢測標準方法審議及公告。